Cientistas de todo o mundo estão cada vez mais efetuando experimentos científicos totalmente executados e analisados através de computadores. Grande parte dos chamados experimentos in silico correspondem à composição de vários programas em seqüência, onde a saída de um deles é utilizada como entrada de dados do próximo, com a utilização de uni grande número de bancos de dados. Normalmente, esses diversos programas são executados com controle manual pelos cientistas ou através do uso de linguagens de scripts, como Perl. Este tipo de abordagem ajuda na automatização da cadeia de execução, mas possui grande deficiência em questões como flexibilidade, interoperabilidade, clareza, registros de uso, manutenção e evolução.
Workflows científicos representam uma alternativa atraente para a descrição deste tipo de experimento, além de fornecer o apoio necessário ao ciclo de "execução e análise" inerente ao processo de busca de conhecimento. Aliados à tecnologia de serviços Web, pode-se criar um ambiente com independência e interoperabilidade entre as diversas aplicações científicas e os diversos bancos de dados. Apesar do uso bem sucedido dessas tecnologias na área comercial, seu uso em bioinforrnática ainda é incipiente. Neste contexto, o objetivo desta tese é a elaboração, prototipação e avaliação de um ambiente integrado, chamado de Ambiente 10+C, para a definição e execução de experimentos in silico através de workflows científicos compostos de diversas aplicações disponíveis como serviços Web. Um experimento real de bioinformática, chamado MHOkline, foi implementado neste ambiente para validar e confirmas a proposta desta tese e analisar a viabilidade de sua implementação em um sistema de produção.
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